Σε δείγματα από πρόδρομα στάδια του πολλαπλού μυελώματος, ενός καρκίνου του αίματος, ορισμένες ενδείξεις κακοήθειας είχαν διαφύγει από την πρώτη ανάλυση. Η Αλεξαντρίνα Γκόεβα και οι συνεργάτες της τις εντόπισαν όταν εξέτασαν τη δραστηριότητα των γονιδίων κύτταρο προς κύτταρο.
Με τη μέθοδο μηχανικής μάθησης HiDDEN ξεχώρισαν μέσα στο δείγμα τις μικρές ομάδες κυττάρων που έφεραν τις αλλαγές.
Η δρ Γκόεβα, με διδακτορικό στη Στατιστική, επέστρεψε τώρα στην πρωτεύουσα της Βουλγαρίας για να αναλάβει το νέο πρόγραμμα του INSAIT στο Πανεπιστήμιο της Σόφιας, το οποίο ανακοίνωσε στις χθες το υπουργείο Παιδείας και Επιστήμης της Βουλγαρίας.
Το ερώτημα για τη νέα ομάδα είναι ποιες από τις αλλαγές που προκαλεί μια νόσος στα ανθρώπινα κύτταρα θα μπορούσαν να αντιστραφούν με τη δράση μιας ουσίας.
Από τα δεδομένα στις δοκιμές
Συνδυάζοντας μηχανική μάθηση, μαθηματικά και βιολογία, οι ερευνητές θα ψάξουν σε μεγάλους όγκους δεδομένων για αλλαγές που εμφανίζονται νωρίς στην πορεία μιας νόσου και μπορεί να περάσουν απαρατήρητες στις συνήθεις αναλύσεις.
Θα χρησιμοποιήσουν αυτές τις πληροφορίες για να προβλέψουν πώς θα αντιδρούσαν τα κύτταρα σε διαφορετικές ουσίες, μόνες τους ή σε συνδυασμό, και ποιες θα μπορούσαν να τα φέρουν πιο κοντά στη φυσιολογική λειτουργία τους.
Καθώς ένα εργαστήριο μπορεί να ελέγξει μόνο ένα μικρό μέρος των πιθανών συνδυασμών, οι προβλέψεις θα βοηθούν την ομάδα να αποφασίζει ποιοι θα δοκιμαστούν πρώτοι.
Η προηγούμενη δουλειά της δρ Γκόεβα δείχνει πόσο λεπτές μπορεί να είναι οι αλλαγές που αναζητούν οι ερευνητές. Σε πείραμα σε ποντίκια, η HiDDEN ξεχώρισε μια ομάδα κυττάρων στα τοιχώματα των αγγείων του εγκεφάλου με μεταβολές που συνδέονται με πρώιμη δυσλειτουργία του αιματοεγκεφαλικού φραγμού.
Η ερευνήτρια είχε εργαστεί για επτά χρόνια στο Broad Institute του MIT και του Χάρβαρντ και στη συνέχεια συγκρότησε τη δική της ομάδα μηχανικής μάθησης και υπολογιστικής βιολογίας στο Πανεπιστήμιο του Τορόντο.
