Μια «χοντροειδώς μεθοδευμένη πολιτική δίωξη» που στόχο έχει να «πληγεί η Νέα Δημοκρατία, ενόψει των επικείμενων εκλογών» χαρακτηρίζει ο Χρήστος Μαρκογιαννάκης την ποινική δίωξη που ασκήθηκε σε βάρος του από τον εισαγγελέα Ιωαννίνων για την υπόθεση του Βαγγέλη Γιακουμάκη. Επιπλέον, κάνει λόγο για «κατάχρηση εξουσίας» αλλά και για μία «απίστευτα προκλητική και βάναυση κακοποίηση του αποδεικτικού υλικού».
Ο Χρήστος Μαρκογιαννάκης, που είναι υποψήφιος βουλευτής, κατηγορείται ότι είχε παρέμβει στον τότε διευθυντή της Γαλακτοκομικής Σχολής Ιωαννίνων για να μην τιμωρηθούν σπουδαστές από την Κρήτη που είχαν προκαλέσει επεισόδια.
Σε βάρος του ασκήθηκε ποινική δίωξη για ηθική αυτουργία σε παράβαση καθήκοντος.
Παράλληλα, ο εισαγγελέας άσκησε ποινική δίωξη για παράβαση καθήκοντος κατά δύο μελών της προηγούμενης διοίκησης της Γαλακτοκομικής Σχολής Ιωαννίνων.