Δυστυχώς τα επεισόδια δεν έλειψαν από τον τελικό του Κυπέλλου Ελλάδας. Σε έναν αγώνα-«γιορτή» για το ελληνικό ποδόσφαιρο, βρέθηκαν ξανά κάποιοι ανεγκέφαλοι οπαδοί που προκάλεσαν ένταση και δημιούργησαν σκηνές ντροπής στο Πανθεσσαλικό Στάδιο, περίπου 1,5 ώρα πριν από την έναρξη της μεγάλης αναμέτρησης.
Μερίδα οπαδών του ΠΑΟΚ και της ΑΕΚ συνεπλάκησαν στην αερογέφυρα, στο πίσω μέρος του σταδίου. Οι αστυνομικές δυνάμεις βρίσκονταν στις κερκίδες, στη «νεκρή» ζώνη που έχει δημιουργηθεί, και είχαν αφήσει το πάνω διάζωμα ουσιαστικά χωρίς φύλαξη. Γεγονός, που δημιούργησε μεγάλο πρόβλημα, με οπαδούς των δύο ομάδων να δίνουν για λίγα λεπτά μάχες σώμα με σώμα. Σημειώθηκαν μικρής έκτασης επεισόδια, κατά τη διάρκεια των οποίων έγινε χρήση δακρυγόνων και φωτοβολίδων κρότου-λάμψης, ενώ ακολούθησε, μέσα σε μια αποπνικτική ατμόσφαιρα, κυνηγητό στους γύρω δρόμους και πετροπόλεμος.
Επίσης, μέσα στο στάδιο, στην πλευρά όπου κάθονται οι οπαδοί του ΠΑΟΚ, υπήρξε ένταση. Μερίδα οπαδών πέρασαν τα διαχωριστικά κιγκλιδώματα και ήρθαν σε σύγκρουση με τις δυνάμες των ΜΑΤ. Στο μεταξύ, πρόβλημα δημιουργήθηκε και με τη μετάβαση της αποστολής του ΠΑΟΚ στο στάδιο. Το πούλμαν της ομάδας «κόλλησε» σε σημείο της διαδρομής όπου ήταν σταθμευμένα αυτοκίνητα και επιστρατεύτηκε ένα μικρότερο λεωφορείο για να μεταφέρει (με καθυστέρηση) παίκτες και τεχνικό τιμ στο Πανθεσσαλικό.