Συνολική ποινή 9,5 ετών –μετατρέψιμη σε χρηματική, που φθάνει το ποσό των 60.000 ευρώ– επέβαλε το Τριμελές Εφετείο Πλημμελειοδικών στον π. Αντώνιο για κατηγορίες που αφορούν βάναυσες τιμωρίες παιδιών που φιλοξενούνταν στις δομές της «Κιβωτού του Κόσμου». Στους τέσσερις συγκατηγορούμενους του ιδρυτή της ΜΚΟ το δικαστήριο επέβαλε ποινές 55,5 μηνών, 40 μηνών, 25 μηνών και 20 μηνών.
Για τον Αντώνιο Παπανικολάου η ποινή μετατράπηκε σε χρηματική προς 10€ ημερησίως, ενώ για τους άλλους δύο που έλαβαν μικρότερες ποινές, το δικαστήριο αποφάσισε να ανασταλεί η ποινή.
Παράλληλα οι δικαστές έκριναν ότι τέσσερις μάρτυρες πρέπει να ελεγχθούν για ψευδομαρτυρία και έτσι θα διαβιβάσουν τα πρακτικά της δίκης στην Εισαγγελία Πρωτοδικών ώστε να διενεργήσει έρευνα. «Κατέθεσαν ψέματα στη δίκη σε δεύτερο βαθμό, σε σχέση με όσα κατέθεσαν στη δίκη σε πρώτο βαθμό. Συνάγεται ότι μπορεί να είναι προϊόν πίεσης. Αλλά αυτό θα ερευνηθεί από τον εισαγγελέα. Να ερευνηθούν και τυχόν ηθικοί αυτουργοί στην ψευδομαρτυρία» ανέφερε η εισαγγελέας της Έδρας που ζήτησε τη διαβίβαση των πρακτικών για τη διενέργεια έρευνας.
Σε πρώτο βαθμό ο πατέρας Αντώνιος είχε καταδικαστεί σε 4 χρόνια και 3 μήνες φυλάκισης, μετατρέψιμα σε χρηματική ποινή. Είχαν καταδικαστεί επίσης τέσσερις στενοί συνεργάτες του σε ποινές φυλάκισης 17-40 μηνών, και σε όλους τους καταδικασθέντες είχε χορηγηθεί τριετής αναστολή.
Η συγκεκριμένη υπόθεση, που άνοιξε πριν από περίπου δύο χρόνια, αποτελεί μία από τις τρεις δικογραφίες που βρίσκονται ενώπιον της Δικαιοσύνης. Οι άλλες δύο είναι για κακουργήματα: η μία αφορά καταγγελίες για σεξουαλική κακοποίηση παιδιών από τον κληρικό, και η άλλη την οικονομική διαχείριση της ΜΚΟ.
